| Presidente del Consiglio | ||
| Romano Prodi | ||
| VicePresidenti del Consiglio | ||
| Massimo D'Alema | candidato | Camera |
| Francesco Rutelli | candidato | Senato |
| Sottosegretari di Stato alla Presidenza del Consiglio | ||
| Enrico Letta | candidato | Camera |
| Enrico Micheli | non confermato | |
| Fabio Gobbo | non confermato | |
| Ricardo Franco Levi | candidato | Camera |
| Ministri senza portafoglio | ||
| Affari Regionali e Autonomie Locali | ||
| Ministro: Linda Lanzillotta | candidato | Camera |
| Sottosegretario: Pietro Colonnella | non confermato | |
| Attuazione del programma di Governo | ||
| Ministro: Giulio Santagata | candidato | Senato |
| Riforme e Innovazioni nella pubblica amministrazione | ||
| Ministro: Luigi Nicolais | candidato | Senato |
| Sottosegretari: | ||
| Beatrice Magnolfi | non confermato | |
| Gian Piero Scanu | candidato | Senato |
| Diritti e pari opportunità | ||
| Ministro: Barbara Pollastrini | candidato alla Camera | Camera |
| Sottosegretario: Donatella Linguiti | Rifondazione Comunista | |
| Politiche europee | ||
| Ministro: Emma Bonino | Candidato | Senato |
| Rapporti con il Parlamento e Riforme istituzionali | ||
| Ministro: Vannino Chiti | candidato | Senato |
| Sottosegretari: | ||
| Giampaolo D'Andrea | non confermato | |
| Paolo Naccarato | candidato | Camera |
| Politiche per la famiglia | ||
| Ministro: Rosy Bindi | candidato | Camera |
| Sottosegretario:Chiara Acciarini | non confermato | |
| Politiche Giovanili e Attività sportive | ||
| Ministro: Giovanna Melandri | candidato | Camera |
| Sottosegretari: | ||
| Giovanni Lolli | candidato | Camera |
| Elidio de Paoli | non confermato | |
| Ministri con portafoglio | ||
| Affari Esteri | ||
| Ministro: Massimo D'Alema | candidato | Camera |
| Vice Ministri: | ||
| Ugo Intini | Rosa Nel Pugno | |
| Patrizia Santinelli | Rifondazione Comunista | |
| Franco Danieli | non confermato | |
| Sottosegretari: | ||
| Famiano Crucianelli | non confermato | |
| Donato di Santo | non confermato | |
| Gianni Vernetti | candidato | Camera |
| Vittorio Craxi | Socialilsti | |
| Interno | ||
| Ministro: Giuliano Amato | ritirato | |
| Vice Ministro: Marco Minniti | candidato | Camera |
| Sottosegretari: | ||
| Marcella Lucidi | candidato | Camera |
| Ettore Rosato | candidato | Camera |
| Alessandro Paino | non confermato | |
| Franco Bonato | Rifondazione Comunista | |
| Giustizia | ||
| Ministro: Clemente Mastella | non confermato | |
| Romano Prodi (interim) | ||
| Sottosegretari: | ||
| Luigi Manconi | I Verdi – Sinistra Arcobaleno | |
| Alberto Maritati | Candidato | Senato |
| Luigi Li Gotti | Italia Dei Valori | |
| Economia e Finanze | ||
| Ministro: Tommaso Padoa Schioppa | ritirato | |
| Vice Ministri: | ||
| Vincenzo Visco | ritirato | |
| Robero Pinza | non confermato | |
| Sottosegretari: | ||
| Massimo Tononi | non confermato | |
| Paolo Cento | I Verdi – Sinistra Arcobaleno | |
| Mario Lettieri | non confermato | |
| Alfiero Grandi | non confermato | |
| Casula Antonangelo | Candidato | Senato |
| Nicola Sartor | non confermato | |
| Sviluppo economico | ||
| Ministro: Pierluigi Bersani | Candidato | Camera |
| Vice Ministro: Sergio D'Antoni | Candidato | Camera |
| Sottosegretari: | ||
| Filippo Bubbico | candidato | Senato |
| Alfonso Gianni | Rifondazione Comunista | |
| Marco Stradiotto | non confermato | |
| Università e Ricerca | ||
| Ministro: Fabio Mussi | Mussi ha lasciato i DS | |
| Sottosegretari: | ||
| Luciano Modica | candidato | Senato |
| Nando Dalla Chiesa | ||
| Istruzione | ||
| Ministro: Beppe Fioroni | Candidato | Camera |
| Vice Ministro: Mariangela Bastico | Candidato | Senato |
| Sottosegretari: | ||
| Gaetano Pascarella | non confermato | |
| Letizia De torre | candidato | Senato |
| Commercio internazionale | ||
| Ministro: Emma Bonino | Candidato | Senato |
| Sottosegretari: | ||
| Mauro Agostini | candidato | Senato |
| Milos Budin | non confermato | |
| Lavoro e Previdenza sociale | ||
| Ministro: Cesare Damiano | Candidato | Camera |
| Sottosegretari: | ||
| Antonio Montagnino | non confermato | |
| Rosa Rinaldi | Rifondazione Comunista | |
| Solidarietà sociale | ||
| Ministro: Paolo Ferrero | Rifondazione Comunista | |
| Sottosegretari: | ||
| Franca Donaggio | Candidato | Camera |
| Cristina de Luca | Candidato | Camera |
| Difesa | ||
| Ministro: Arturo Parisi | Candidato | Camera |
| Sottosegretari: | ||
| Giovanni Lorenzo Forcieri | Candidato | Camera |
| Emidio Casula | Rosa Nel Pugno | |
| Politiche Agricole, Alimentari e Forestali | ||
| Ministro: Paolo De Castro | Candidato | Senato |
| Sottosegretari: | ||
| Giovanni Mongiello | non confermato | |
| Guido Tampieri | non confermato | |
| Stefano Boco | I Verdi – Sinistra Arcobaleno | |
| Ambiente e Tutela del Territorio e del Mare | ||
| Ministro: Alfonso Pecoraro Scanio | I Verdi – Sinistra Arcobaleno | |
| Sottosegretari: | ||
| Gianni Piatti | non confermato | |
| Bruno Dettori | Candidato | Senato |
| Laura Marchetti | Rifondazione Comunista | |
| Infrastrutture | ||
| Ministro: Antonio Di Pietro | Italia Dei Valori | apparentato |
| Vice Ministro: Angelo Capodicasa | Candidato | Camera |
| Sottosegretari: | ||
| Luigi Meduri | non confermato | |
| Tomaso Casillo | Rosa Nel Pugno | |
| Trasporti | ||
| Ministro: Alessandro Bianchi | Comunisti Italiani | |
| Vice Ministro:Cesare de Piccoli | non confermato | |
| Sottosegretari: | ||
| Andrea Annunziata | non confermato | |
| Raffaele Gentile | Socialisti Democratici Italiani | |
| Salute | ||
| Ministro: Livia Turco | Candidato | Camera |
| Sottosegretari: | ||
| Serafino Zucchelli | non confermato | |
| Antonio Gaglione | Candidato | Camera |
| Giampaolo Patta | non confermato | |
| Beni e Attività Culturali | ||
| Ministro: Francesco Rutelli | Candidato | Senato |
| Sottosegretari: | ||
| Andrea Marcucci | Candidato | Senato |
| Elena Montecchi | non confermato | |
| Danielle Mazzonis | Rifondazione Comunista | |
| Comunicazioni | ||
| Ministro: Paolo Gentiloni | candidato | Camera |
| Sottosegretari: | ||
| Luigi Vimercati | Candidato | Senato |
| Giorgio Calò | Italia Dei Valori | apparentato |